پیش بینی و مطالعهqspr بازداری ترکیبات آلی، دارویی و آلاینده ها با استفاده از رگرسیون بردارهای پشتیبان
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران
- نویسنده الهام باهر
- استاد راهنما محمد حسین فاطمی محمد رضا حاج محمدی
- سال انتشار 1388
چکیده
چکیده پژوهش حاضر در شش قسمت به منظور بررسی رابطه qspr/qsar ترکیبات مختلف با استفاده از روش های متفاوت مدلسازی خطی و غیرخطی انجام گردید. همچنین اثر روش های گوناگون انتخاب متغیر بر مدل های ایجاد شده، مورد بررسی قرار گرفت. در بخش اول، هدف، ارائه یک مدل qsar جهت پیش بینی فاکتور بزرگنمایی زیستی برخی از آلاینده های ارگانوکلره است. بدین منظور پس از محاسبه توصیف کننده های مولکولی از روش های رگرسیون خطی چندتایی (mlr) و الگوریتم ژنتیکی (ga) برای انتخاب توصیف کننده های موثر در فاکتور بزرگنمایی زیستی استفاده شد. سپس توصیف کننده های انتخابی به عنوان ورودی برای مدل های mlr و شبکه عصبی مصنوعی (ann) بکار گرفته شدند که در نتیجه مدل ga-ann با انحراف استاندارد 03/0 و 20/0 برای سری آموزشی و آزمون، انتخاب شد و در نهایت از روش آنالیز حساسیت برای تعیین اهمیت نسبی توصیف کننده ها در ann استفاده گردید. در بخش دوم، پیش بینی فاکتور بازداری برخی از مشتقات بنزن و هتروسیکل ها در کروماتوگرافی مایسلی الکتروسینتیک (mekc) با استفاده از مدل ann انجام شد، بدین منظور توصیف کننده های موثر با استفاده از روش mlr مرحله ای انتخاب شدند و پارامترهای آماری q2 و spress پس از آزمون ارزیابی تقاطعی برای مدل های mlr و ann بدست آمدند که مقایسه این نتایج، برتری مدل ann را با 57/0=q2 و 55/0=spress نشان داد. در بخش سوم، ثابت سرعت تخریب آلکنها با رادیکال oh به عنوان معیاری از طول عمر تروپسفری آنها با استفاده از روش های mlr، ann و ماشین بردار پشتیبان (svm) مورد مدل سازی قرار گرفت. همچنین انتخاب متغیر با دو روش mlr و ga انجام شد و نتایج حاصل از مدل سازی آنها مقایسه گردید که نتایج برتری مدل ga-ann را نشان می دهد. همچنین به منظور بررسی اهمیت توصیف کننده ها در ann روش توزیع نسبی مورد استفاده قرار گرفت. در بخش چهارم، مطالعه qspr پتانسیل نیمه موج اکسایش بنزواکسازین ها با روش svm انجام شد پس از انتخاب توصیف کننده های موثر به روش هیورستیک (hm) و تقسیم سری داده به دو گروه آموزشی و آزمون، چگونگی توزیع مولکول ها در فضای ساختاری آنها توسط روش آنالیز پراکندگی مورد بررسی قرار گرفت. به منظور ارزیابی بیشتر مدل از روش ارزیابی تقاطعی استفاده گردید که مقادیر920/0=q2 و 020/0=spress برای مدل mlr و 949/0=q2 و 015/0=spress برای مدل svm بدست آمد. مقایسه نتایج حاصل، برتری مدل svm را نشان می دهند. در بخش پنجم، مدل سازی اندیس بازداری آلکیل فنول ها انجام شد. بدین منظور پس از محاسبه و انتخاب توصیف کننده ها و بررسی آنالیز پراکندگی، روش های svm و mlr برای ایجاد مدل بکار رفتند. همچنین روش ارزیابی تقاطعی برای ارزیابی بیشتر مدل مورد استفاده قرار گرفت که مقادیر896/0=q2 و 680/0=spress برای مدل mlr و 893/0=q2 و 670/0=spress برای مدل svm بدست آمد. مقایسه پارامترهای آماری، برتری مدل svm را نشان داد. در بخش ششم نیز به منظور پیش بینی حلالیت آبی برخی از داروها، از ماشین بردار پشتیبان استفاده شد. برای انتخاب توصیف کننده های موثر از روش ga و mlr مرحله ای استفاده گردید و آنالیز پراکندگی داده ها بر روی آنها انجام شد. پس از انجام ارزیابی تقاطعی و مقایسه نتایج مدل svm و mlr و کارهای انجام شده قبلی، برتری مدل ga-svm به اثبات رسید. واژه های کلیدی شبکه عصبی مصنوعی، ماشین بردار پشتیبان، الگوریتم ژنتیک، رگرسیون خطی چندتایی، آنالیز حساسیت، آنالیز پراکندگی مولکول ها.
منابع مشابه
The Study of Stressful Factors in Clinical Education for Nursing Students Studying in Nursing and Midwifery College in Khorramabad
کچ هدي پ شي مز هني فده و : شزومآ لاب يني شخب ساسا ي شزومآ مهم و راتسرپ ي تسا . و هنوگ ره دوج لکشم ي شزومآ رد لاب يني ، آراک يي هدزاب و ا ني شزومآ زا شخب راچد ار لکشم م ي دنک . فده اب رضاح شهوژپ سررب ي لماوع سرتسا از ي شزومآ لاب يني رد وجشناد ناي راتسرپ ي هدکشناد راتسرپ ي و يامام ي ماـجنا داـبآ مرـخ تسا هتفرگ . شور و داوم راک : رضاح هعلاطم کي هعلاطم صوت يفي عطقم ي تسا . د...
متن کاملThe effect of cyclosporine on asymmetric antibodies and serum transforming growth factor beta1 in abortion-prone model of mice CBA/J x DBA/2
كچ ي هد فده و هقباس : ي ک ي طقس زورب للع زا اه ي ،ررکم ا لماوع تلاخد ي ژولونوم ي ک ا رد ي ن قم طققس عون ي وراد دقشاب ي س ي روپسولک ي ،ن ح لدم رد طقس شهاک بجوم ي ناو ي CBA/j×DBA/2 م ي تنآ ددرگ ي داب ي اه ي ان و راققتم TGF-β لماوع زا عت مهم يي ن گلماح تشونرس هدننک ي سررب روظنم هب رضاح هعلاطم تسا ي ات ث ي ر اس ي روپسولک ي ن م رب ي از ا ي ن تنآ عون ي داب ي س و اه ي اکوت ي ن TGF...
متن کاملمقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure
کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...
متن کاملپیش بینی اثرات بازداری بعضی ترکیبات دارویی باروشهایqsar
در این پروژه، مطالعات ارتباط کمی ساختار- فعالیت ((qsar بر روی ثابت بازداری (ki) 77 ترکیب دارویی از مشتقات پایپرازینیل گلوتامات پیریدین که به عنوان ترکیبات ضد لخته شدن خون عمل می کنند، انجام شد. برای انتخاب مهمترین توصیف کننده ها رگرسیون خطی مرحله ای مورد استفاده قرار گرفت، سپس توصیف کننده های مهم به عنوان ورودی برای ایجاد مدل های qsar با استفاده از رگرسیون خطی چندگانه (mlr)و شبکه عصبی مصنوعی (a...
15 صفحه اولThe study of relationship between the tension-making factors and mental health of Semnan nurses
هديكچ فده و هقباس : راتسرپ هفرح ي م رد سرتسارپ لغاشم ردص رد ي ب لغاشم نا تشاده ي نامرد و ي لـماوع و دراد رارـق سرتسا از ي لغش ي ددعتم ي ناور تملاس ي لغاش ي ا ن ي م رارق رطخ ضرعم رد ار هفرح ن ي دهد . فدـه اـب رـضاح شهوژپ سررب ي ت أ ث ي نت لماوع ر ي گد ي ناور تملاس رب از ي نانمس رهش ناراتسرپ دش ارجا . شور و داوم اه : رامآ هعماج ي زا دوب ترابع لك ي ر ناراتسرپ ه مس ي ب ي ناتسرام اه ي رهش هك ...
متن کاملپیش بینی مقاومت دارویی ویروس hiv با استفاده از ماشین های بردار پشتیبان
مقدمه: پژوهش حاضر با هدف بررسی عملکرد روش یادگیری ماشین های بردار پشتیبان برای پیش بینی مقاومت دارویی ویروس hiv) یا (human immunodeficiency virus استفاده از تحلیل دنباله ی آمینو اسیدها انجام گرفت. روش ها: در این مطالعه از ماشین های بردار پشتیبان استفاده شد؛ همچنین برای آموزش و آزمایش ماشین های بردار پشتیبان از نرم افزار libsvm) یا (library for support vector machinesاستفاده گردید. یافته ها: نت...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023